同仁堂清胃黄連丸は黄色または深い黄色の水丸で、味が微苦です。清胃黄連丸は口内炎、歯茎や咽喉の腫れ痛みに用いられます。

同仁堂黄連羊肝丸は黒褐色の大蜜丸で、味が苦です。黄連羊肝丸は肝火旺盛（怒れば気が上逆する）による目が赤くて腫れ痛み、視力が減退、光に弱く、明るい光線で涙がポロポロ出る、風にあたると流涙するなどに用いられます。